In de 19e eeuw, de eeuw van de Grote Verlichting, stonden wetenschap en Kerkelijke macht lijnrecht tegenover elkaar. De wetenschappers waren steeds op zoek naar het hoe en het waarom van het leven in het universum. De conservatieve en behoudsgezinde Kerk wilde dit uit alle macht beknotten. Darwin en de Vlaamse dorpspasstoor Romonil verpersoonlijken in dit boek deze strijd.
Van 1831 to 1836 maakte Darwin de belangrijkste zeereis ooit. Zijn ontdekkingen en zijn conclusies zullen de rest van zijn leven beheersen en uitmonden in de publicatie van zijn beroemde Evolutietheorie. Romonil, die doordrenkt is van de superieure positie van God in de schepping, volgt elke stap in Darwins leven. Hij verdenkt Darwin deze zeereis te maken om bewijzen te vinden tegen het scheppingsverhaal.
Zowel Darwin als Romonil wijden hun hele leven aan hun overtuiging. Darwin, door zijn jarenlange studie én vooral om zijn onderzochte feiten kenbaar te maken. Romonil, door vanop zijn kansel het sociale leven te blijven bepalen én zijn pogingen om de doelstellingen van Darwin te ondermijnen.